Spectronaut™ 近年来一直为DIA实验的数据分析提供最好的解决方案。而最新版本Spectronaut 将目前多个独立的DIA相关分析流程进行了无缝整合,更好的扩展了Spectronaut的应用领域。 Spectronaut®是一个 旨在独立分析数据获取(DIA)蛋白质组学实验。Spectronaut可以对数百到数千种蛋白质。具有多种条件的大型实验并且可以分析由多达数万次LC-MS运行组成的重复。Spectronaut可以在不使用保留时间校准试剂盒的情况下分析DIA数据。然而强烈建议添加iRT试剂盒,因为它可以确保在困难的矩阵上进行校准并且允许详细的质量控制读数。
1. 构建混合库通过组合其他来源的大规模谱图库(project 或 resource libraries)和样品本身DIA检测数据(directDIA),可以不用自己建库便能得到较大量的定量蛋白数。2. 加入标记的工作流程在混合Biognosys全新PQ500同位素标肽试剂盒,目标蛋白可以通过非标定量的方式进行绝对定量且能够跨越5个数量级。3. 宿主细胞蛋白通过矫正残留蛋白,可以对低丰度的宿主细胞蛋白进行高精度的定性定量。“Spectronaut X 在混合库建立过程中能够整合DDA和DIA数据,在我们的实践中发现可以得到更好的结果并以此开发全新的数据采集策略。” Spectronaut®18.0主要发布功能❖ 大大提高了定量(CV<10%的蛋白质增加了12%)
❖ 通过命令行支持Linux(直接加载Bruker和Thermo文件,Sciex通过
HTRMS)
❖ 改进的蛋白质鉴定(平均增加5%)
❖ 增加了对directDIA的搜索存档支持+
❖ 极大扩展了命令行功能
❖ 优化和改进了云安装的许可。
❖ 增加了对SNE联合收割机的MaxLFQ支持
❖ 所有长方体绘图的小提琴绘图选项
❖ 改进了管道处理过程中的错误和警告反馈
❖ 在分析概述中增加了“量化”摘要节点
❖ 在定期DIA分析中直接使用搜索档案(.psar)
❖ 在运行级别上添加每个循环概览图的标识。
❖ 已将所有导出为.XLS的文件更改为.TSV
❖ 新的默认量化设置(通过DIA分析→ 量化→ 量化
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8020169@qq.com