可定制且易于导航的界面，FlowJo的界面是用户友好的，包括主工作区和几个带有标签带的条带，允许您滚动各种波段以访问不同的任务。该应用程序为您提供了使用常用的首选任务自定义每个波段的方法。此外，您可以在工作区上拖放样本或条带。
“组”部分允许您按照要分析的顺序组织样本。通过右键单击样本，您可以修改组设置，包括名称，颜色，字体样式，角色，样本包含标准和分配。对于每个示例，您可以执行各种操作，例如添加关键字或统计信息，在空间可旋转可视化窗口中显示数据集以及将文件连接在一起。
生成子集以进行深入分析，FlowJo利用一系列高级选通工具，可以促进流程生成子集，直到集合仅包含需要3D图表或分析统计数据的单元格。 “统计”选项使您可以计算总体频率（频率），变异系数（CV）和中值荧光强度（MFI）。
强大的流式细胞仪，总的来说，FlowJo是一个方便的软件应用程序，专门为您提供进行流式细胞数据深入分析所需的所有工具。该应用程序包括在线帮助手册和指南，以及向您解释每个功能基础知识的工具提示。
更新日志
10.6发行说明
新功能：
光谱补偿现在可用于在补偿向导中补偿由超定系统（比荧光探针更多的检测器）收集的数据。
现在可以覆盖FlowJo v10中由Platforms生成的图形！是的，您已正确阅读，现在可以在FlowJo的布局编辑器中叠加：动力学，细胞周期和增殖平台图。
自动保存工作区功能–新的首选项设置使研究人员可以在可自定义的时间间隔内自动保存分析。许多研究人员都要求使用此流行功能，并且我们听到了您的声音。
FACSDiva™分析现在通过一组功能集成在FlowJo中，这些功能可从FACSDiva™工作区导入门控，并从FlowJo导出门作为FACSDiva™XML工作区文件。
更新
“光谱补偿”选项可用于补偿“补偿向导”中适当收集的数据。
布局编辑器中现在提供以下平台叠加：动力学，细胞周期和增殖。
自动保存工作区功能–新的首选项设置使研究人员可以在可自定义的时间间隔内自动保存分析。许多研究人员都要求使用此流行功能，并且我们听到了您的声音。
安装最新版本的FlowJo不再自动覆盖Windows计算机上的先前安装，并且现在对安装进行了版本控制。
将覆盖范围从单变量切换为双变量不再删除先前设置的总体着色。
修复了以前在某些工作流程中停止工作的键盘快捷键。
现在，颜色映射图不再基于每个总体进行归一化，而是严格利用研究人员为与Graph Windows相关的“自定义轴”对话框中的参数设置的缩放比例。
现在，颜色映射图在切换时可以正确显示“大圆点”和“显示网格”。
现在在祖先图中正确显示了四重门。
现在可用于FlowJo的多图颜色映射 –使研究人员可以将感兴趣的参数快速地颜色映射到双变量图上。对于说明tSNE等嵌入式空间的趋势特别有用。
CytoFlex数据文件现在可以正确连接；以前的关键字格式错误。
导出对话框中，“不超过”下采样选项现在再次起作用。
对数和Biex变换现在包括正十进制滑块，用于结合宽度基础和负十进制来调整渐近十进制的大小。
现在，SampleID扩展仅限于在此处保持空白b / w分类值。
FACSDiva™门控现在可以导出和导入。
现在可以通过特殊对话框使用自动命名列标题功能。
“另存为ACS”对话框现在说明了浏览器中的其他文件。
已知的问题
单击右上/左上角的“ x”图标无法关闭FlowJo Portal身份验证对话框。 解决方法： 单击“取消”图标以终止对话框。
身份验证–在某些使用情况下，24小时离线宽限期（对于FlowJo网站许可序列号用户）将无法正确激活。
在不创建名称的情况下，将模板保存的工作空间保存在与创建模板的工作空间相同的位置，将覆盖原始工作空间。 解决方法： 确保对工作空间进行唯一命名。
双击ACS文件将打开FlowJo，但不会打开工作区本身。 解决方法： 通过将ACS文件拖放到打开的FlowJo工作区中，或通过“文件”选项卡/“打开”对话框来加载ACS文件。
FlowJo不允许用户用文本替换关键字值系列中的数字。 解决方法： 使用键盘上的Tab键遍历正确的字段以输入关键字。
在命名对话框中连续滚动到总体名称的末尾会引发错误。
与组拥有的门相比，应用于组的扩散节点将不会具有相同的功能，即，当一个节点发生更改时，应用于同步组的扩散节点将不会自动调整，并且扩散节点的颜色/字体样式将与它们的组不匹配。
补偿金
使用补偿向导期间对参数比例的更改将重置在该对话框中所做的更改。 解决方法： 在补偿之前设置参数的缩放比例。
FlowJo Envoy浏览器
单击“否”以替换FlowJo Envoy工作流程中的文件，将关闭浏览器。
打开与当前正在使用的另一个FlowJo Envoy区域关联的工作空间时出错。 解决方法： 仅访问与您当前的FlowJo Envoy环境关联的工作空间。
可以将非标准字符作为文件或工作区名称（包括空格和加号）输入，这可能会导致下游问题。 解决方法： 请确保仅将标准字母数字字符用于数据并分析文件命名。
布局和表格编辑器
共享工作区时，标题图标不会在计算机之间转移。
使用NxN绘图批量处理布局可能会导致工作空间损坏。 解决方法： 批处理后创建NxN个图。
批处理文本框无法编辑。
调整覆盖图的设置时，控制人群可能会失去控制状态。
外挂程式
当文件或文件路径包含空格或特殊字符时，基于R的插件将不起作用。 解决方法： 从数据文件和文件路径中删除空格和特殊字符。
