mriCroN破解版是一款功能强大的医学影像分析软件，旨在帮助用户进行扫描，X射线和其他类似的医学图像进行分析，并支持对医学影像的各个部分进行照片创建并进行排列，方便用户快速进行比较分析，可浏览各种各样的图像格式，包括SPM分析格式，包括原始图像资料的img格式文件和一个描述图像维度的hdr格式的文件的图像，加快医学分析过程，找出病症所在，医学工作人员必备，软件绿色无需安装，解压即可使用，需要的朋友不要错过了！
功能特色
1、简单和平易近人的界面
MRIcron的界面非常容易处理，这意味着您不需要很多以前的使用经验就可以使用它。主工具栏包含您可能想要使用的所有组件，如“切换十字线”，“笔工具”或“填充工具”。
2、加载您的图像并选择查看模式
MRIcron允许您从“文件”菜单打开需要的文件，将其载入主窗口，让您在三个不同的面板中在X，Y和Z轴上查看它。可用的视图模式是“轴向”，“冠状”，“矢状”或“多个”。
3、方便的DICOM查看器
综上所述，MRIcron是一种可靠且易于使用的实用程序，您可以在需要使用扫描，X射线和其他类似的医学图像时使用该程序，从而使您可以在很短的时间内完成分析。
4、可以移动图片并对其进行调整，以便访问和分析某个图层。此外，MRIcron为您提供“MultiSlice”功能，可为医学影像的各个部分创建单张照片，并将它们排成队列，以帮助您更迅速地进行比较。
使用教程
1、
启动NPM并打开设计窗口（VLSM / Design ...）。 将出现一个电子表格。 选择文件/打开并查看文件continuous.val。 每行显示每位患者的表现，例如患者1标识了2项，而患者2检测到了44项。 请注意，使用此软件的分数越高，反映出性能越好 如果您有二项数据（表现属于两个不同的分类），您应该表示0表示存在赤字，而一项表示健康表现。 请注意，左列中列出的文件名和右列中的表现总是对应于同一患者。
2、需要首先描述病变图并命名行为表现指标，选择查看/设计来调出描述窗口。
预测因子：显示行为度量的数量 - 这里我们只是检查字母取消表现。
预测器名称：对于每个预测器，插入易于记忆的名称，例如'取消'我们的信件查找任务。
您可以通过按下“选择图像”按钮来选择您的病变地图的文件名，以从所有参与者中选择病变图。您应该同时选择所有图像，所有图像应放置在一个文件夹中（例如，您的病变图可能是C：\ dataset \ 1.voi，C：\ dataset \ 2.voi等）。病变图像可以在MRIcron VOI，NIfTI.nii，压缩的NIfTI.nii.gz或分析（.hdr / .img）格式中。如果您确实选择了图像，请确保文件名与患者的表现相符，如步骤1所述。
您也可以设置一个先验最小病灶密度阈值。例如，当分析22人时设置10％的值意味着统计数据仅针对超过2人受损的体素计算。此阈值的大数可以增加您的统计功效，因为您只会计算常见受伤体素的统计数据。然而，较大的值将无法检测到可靠的预测赤字的受损区域。请注意，此值基于体素中病变的总发生率，而不考虑行为表现。
3、接下来，我们需要计算统计结果，您可以通过选择MRIcron的绘图/统计菜单中的项目进行一些统计。
4、NPM现在将计算所要求的测试，它将创建所有患者的重叠图像（例如sum.nii.gz）和统计图（BM.nii.gz用于连续数据，L.nii.gz用于二项数据）。
5、
查看结果
我们可以打开生成的统计图，并将它们放在解剖扫描的顶部。 如果您的病变地图与立体定位MNI空间对齐，则可以在其中一个标准模板（File / OpenTemplates / ch2）之上打开它们。 这是一个快速指南：
启动MRIcron并选择File / OpenTemplates / ch2bet作为我们的背景图像
选择叠加/添加并选择在上一步中创建的统计图（例如C：\ dataset \ binL.nii.gz）。
当MRIcron检测到统计图时，它计算每个测试的p值以确定错误发现率（FDR）阈值 - 例如 您的数据中存在多少强大的信号。 MRIcron显示Z分数的直方图。 请注意，在下面的例子中，大多数数据的正Z分值表明一个强大的信号（如果我们的数据仅仅是噪声，我们应该看到钟形分布的平均值为0，而平均Z分数为2左右）。
6、
MRIcron显示覆盖图。请注意屏幕底部的软件会报告临界值：p05 / p01值对应于非正确的p <0.05和p <0.01值，这些值非常宽松（这些测试会产生很多虚假警报，例如，在这里我们已经进行了16082次测试，所以p05应该会导致很多误报）。 fwe05和fwe01的值与Bonferroni校正后的值相对应：该测试非常保守，而且您经常无法检测到真实的效果。 FDR05和FDR01结果反映了错误发现率 - 例如一个FDR05应该显示大约20次真实激活对于每一个误报。请注意，当信号很少或没有信号时，FDR与Bonferroni一样保守，但它适用于数据集中的实际信号。请注意，您可以为覆盖图选择图像阈值和截止值。请注意，默认情况下，除非信号不足，否则我的软件会加载带有从FDR05到FDR01的阈值的统计图，在这种情况下，它会使用未校正的0.05 ... 0.01值。另请注意，当前叠加层设置为以单色红色配色方案显示。
7、
下图显示了更改阈值如何改变统计叠加的外观。 考虑左侧面板中显示的原始状态地图，而中间面板的阈值仅显示Z值大于2.5的体素（三个区域保留此阈值），右侧面板显示更多
8、最后我们重复步骤6，来加载多个叠加层，以比较不同的统计测试。
病变映射
MRIcron提供了绘制脑损伤区域的简单工具。然而，重要的是我们所有的病变图都是用相同的图像尺寸和方向绘制的。因此，我们应该在标准模板（例如File / OpenTemplates / CH2）上绘制所有的损伤，或者我们需要首先对所有扫描进行标准化，以使它们成为核心标记，然后使用文件/打开打开每个扫描。
1、 启动MRIcron并打开您的扫描（文件/打开或文件/ OpenTemplate）
2、选择您的绘图工具（这些列在绘图菜单的底部，例如“笔”工具）。
3、绘制您的区域 - 例如，如果您使用“自动闭合笔”工具，只需单击并画出大脑损伤的边界。要填充封闭区域，只需在该区域的中心点击+点击。要清除部分绘图，请按住Shift键。
4、 对存在病变的所有切片重复步骤3（例如，您可以调整显示在左上角的X，Y，Z数字以选择所需的切片。请注意，您也可以使用鼠标滚轮选择切片。
5、当您完成绘制脑损伤区域时，选择绘制/ SaveVOI保存损伤图的副本。
6、对每个人重复步骤1-5，保存来自单个文件夹中所有个体的病变图。
使用说明
重要提示：默认情况下，MRIcron关闭病变绘图工具。要打开MRIcron的病变绘图功能，请选择“帮助/首选项”，并确保选中“显示绘图菜单和工具”复选框。
Flash视频，脚本和示例数据可帮助用户掌握这些技术。
MRIcron旨在将病变部位与行为表现联系起来。例如，它可以帮助识别对语言生成至关重要的大脑区域。为了进行分析，我们需要执行四个步骤：
病灶映射：对于每个人，我们需要绘制脑损伤的程度。
指定设计：我们需要设计我们的实验，创建一个电子表格，将每个人的病灶地图与他们的表现联系起来
计算结果：我们需要进行voxelwise统计分析。
查看结果：我们需要解释结果。
本教程将指导您完成病变数据分析。
MRIcron的副本：该版本将包含一个名为'example \ lesions'的文件夹，其中包含此处描述的示例数据集。
NPM的副本（安装MRIcron时安装）
在本教程中，我假设病变图和设计文件位于文件夹c：\ dataset中，但您可以在任何位置提取文件。请注意，默认情况下这些通常安装到c：\ program files \ mricron \ example \ lesions。样本数据集包括23位患者的模拟病变图。该文件夹还包括.val文件，用于报告取消任务中这些患者的表现。在这项任务中，要求患者在一张杂乱无章的纸上标记字母“A”的每一个出现。这个任务的完美得分是60（当所有的A被检测到时）。文件continuous.val列出了每个患者在这项任务中的表现（得分为2..60），而文件binomial.val列出了该任务的表现为二进制：缺少超过4项的患者被列为失败此任务（ 0），而错过4个或更少项目的患者被列为已通过该任务（1）。请注意，对于连续测量和二项测量，分数越高表示BETTER性能越好。如果分数越低表明表现更好（例如响应时间），则您需要查看统计图中的负Z值或颠倒行为数据的大小。我们已经包括二项和连续值来说明MRIcron可用的统计分析。
