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分子建模分析软件 WaveSpartan 14 v1.1.4 图文教程

  • 软件大小:未知
  • 更新日期:2018-10-09
  • 官方网站:闪电下载吧
  • 软件等级:★★★☆☆
  • 运行环境:Winxp/Win7/Win8/Win10
分子建模分析软件 WaveSpartan 14 v1.1.4  图文教程
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Spartan 14破解版是一款功能强大的专业化学 分子建模和分析软件,拥有广泛的现代计算模型背后的优雅的现代化界面,专业的计算化学分析软件,最可靠的最容易使用的量子化学软件,用于计算电子频谱及有机分子的颜色,也可应用于合成科学!Spartan软件还与剑桥结构数据库连接。 Spartan提供了来自采矿数据的x / y和直方图以及多变量回归分析,CSD是世界上小分子晶体数据的储存库,包含超过900,000个X射线晶体结构。所有Spartan版本都可以无缝地检索蛋白质数据库中的条目。为您展示超越数字和计算的视角,其独特的视觉图像。Spartan拥有计算机图形学功能,允许化学工程师根据精确的参数和计算结果进行精确的图形建模,可用于计算分析,分子结构优化,光谱分析和检查。原子和分子性质。在这个程序中,可以在半实验,初始模型,功能模型和密轴模型中进行分析力学研究,甚至可以使用后期Hartree-Fock模型和热化学指令,包括G3和T1也是可能的。提供了有关分子结构,相对稳定性和其他分子隔离性质的信息。通常在复杂的化学计算中,复杂的分子力学是常见的做法。在Spartan中,很容易进行这样的计算以及各种量子计算,包括Hartree-Fock后期和分子轨道的研究,特别是与电子相关性相关的耗时的计算。Spartan将计算化学(理论模型)应用于计算计算数据任务以确定分子图像,平衡结构和过渡态,MMR,IR,拉曼,可见紫外光谱,原子分子特征和化学反应的许多标准任务他们使用。本次小编带来的是Spartan 14破解版,含破解文件和安装破解图文教程!

安装破解教程

1、在本站下载并解压,如图所示的,Spartan 14打包成四个zip文件和crack破解文件夹
SP14common.zip包含32位和64位版本的通用文件。
SP14SMD.zip包含SMD子集数据库文件。
SP14x64.zip包含64位特定文件。
SP14x86.zip包含32位特定文件。
Sp14V114Setup.exe是安装程序。
2、双击Sp14V114Setup.exe运行安装,如图所示,点击next

3、勾选我接受许可协议,点击next

4、点击浏览选择软件安装路径,点击install安装

5、安装中,稍等一会儿

6、安装完成,选择软件密钥许可选项。取消激活代码对话框。将最crack破解文件夹里的文件复制到软件安装目录中,点击替换目标中的文件,注意选择正确的版本,

功能特色

1、设置Torsions
已经实施了一种新的算法(比以前的例程有了显着的改进),这些分子具有大于6个成员和可旋转键的环(许多(如果不是大多数天然产品适合这一类))。它可能比先前版本快一个数量级。
2、均衡构象。
现在包括一个量子力学入口,它可以选择(两个)多个
步骤程序。返回是根据该程序最后一步使用的方法的最低能量构象(B3LYP / 6-311 + G(2df,2p)[6-311 + G *]或wB97X-V / 6-311 + G(2df,2p)[6-311 + G *])。还提供各种用户定义的程序。
3、Conformer Distribution。
与Equilibrium Conformer任务一样,现在还包括一个量子力学入口,它可以选择(两个)多步骤程序(以及各种用户定义的程序。返回最低能量的构造函数(根据在所选方法的最后一步中使用的方法,B3LYP / 6-311 + G(2df,2p)[6-311 + G *]或wB97X-V / 6-311 + G(2df,2p)[6 -311 + G *]。能量,偶极矩和电荷对应于适当的玻尔兹曼加权平均值。提供了各个构象的补充列表(及其Boltzmann权重)。
4、Boltzmann平均NMR。一项新的计算任务,采用与Conformer Distribution相同的自动化多步程序。 NMR步骤涉及B3LYP / 6-31G *或wB97X-D / 6-31G *。 Boltzmann权重来自B3LYP / 6-311 + G(2df,2p)[6-311 + G *]或wB97X-V / 6-311 + G(2df,2p)[6-311 + G *]) , 分别。
虽然NMR只有两种计算模型选项,但可以使用替代程序来获得玻尔兹曼权重(如在Conformer Distribution中)。 返回的是玻尔兹曼平均化学位移(如果要求,还有耦合常数)。提供了各个构象的补充列表(及其Boltzmann权重)。 这意味着构象柔性分子,但也只有一个构象异构体。 当指定能量或平衡几何任务时,NMR复选框(和新的耦合常数复选框)可用作计算:选项。
5、DP4支持。
Goodman提出的DP4测量可以应用于找到最佳匹配,假设为每个(立体/区域)异构体提供的构象异构体或每个异构体的构象异构体的Boltzmann平均值。
两者都是自动的(从每个异构体的一个构象异构体列表开始),两者都可以基于B3LYP / 6-31G *或wB97X-D / 6-31G *模型进行化学位移计算。
6、耦合常数。
Spartan以前采用Karplus型方法来估计3键HH耦合常数(教科书在绘制质子谱时谈到的内容)。这已经扩展到2键HH耦合常数.2,3和4键(和更高)CH耦合常数“几乎从不”报道数字,但对于2D HMBC光谱的构建是必不可少的,不能凭经验获得。该最新版本包括一个有效的程序(仅涉及所谓的费米接触项和使用所谓的PCJ-0基组),这提供了令人满意的结果。 Spartan可以利用附加条款并使用更大的基准集,但这两种方法都不会带来统计上显着的改进。 CH计算还导致(提供)HH和CC耦合常数。
7、2D NMR光谱。
虽然我们的2D NMR开发的主要目标是产生计算的HMBC光谱,但是通过HH耦合,我们也可以产生COSY光谱。 这些(以各种排列)是两种最流行的实验2D光谱。 以前的Spartan版本具有此功能,但在新版本中,我们还能够将计算的光谱叠加到实验光谱上。 通常情况下,实验数据不会以数字形式报告(仅作为PDF格式),因此我们正在努力实施用户 -
友好的比较手段。 目前,我们有一个程序,用于引入二维光谱的图像,并将该范围/显示拟合到计算的光谱以进行比较。 需要一些手动操作,我们正在努力优化这些工具。
8、2D图纸。
斯巴达衍生的2D图纸(来自草图构建器)将取代我们目前使用的2D图纸库,更重要的是允许我们添加用户提供的任何(有机分子)。 目的是能够将图纸添加到图表,光谱和电子表格(以及其他地方)。 原则上,用户在3D中构建的所有内容都应具有相应的2D绘图。
9、输出摘要
  这已被修改为包含输出为HTML文件,也可以保存为PDF文件,并且(希望按发布时间)可以打印(无需显式通过Adobe工具)。 这些包括质子和碳谱的呈现,因为它通常出现在实验论文中(移位,耦合常数和HMBC相关性)以及HH,CH和CC耦合常数的表。 还有与IR和UV光谱有关的材料。 这是对以前版本的输出文件的重大改进。 与此相关(并且尚未实施)是自动原子重新编号,其中氢具有与它们所连接的碳相同的数字(例如,H12a,H12b用于C12)。
10、图形表面。已经实施背景渗色以改善透明表面的可视化。 可以为任何非固体表面启用“轮廓”以改善表面内部边界的显示(左侧的轮廓打开 -最右边的图像)。

使用说明

选择分子  
Spartan14的窗口中可以同时显示两个或多个分子。但是,可以仅选择一种分子。所选分子可以访问所有功能(分子构建,作业设置和提交以及文本和图形显示和操作),而未选择的分子可能仅显示为静态图像。例外涉及缩放或使用Ctrl键。  
通过单击其结构模型或其任何相关图形表面来选择分子。这导致取消选择先前选择的分子。所选分子的分子特性可在“属性”对话框(“显示”菜单)中找到。  
可以通过随后分别与所选分子相关联的原子,键,图形显示或约束标记来访问原子,键和表面显示属性以及关于几何约束的信息。选定的原子,键和约束标记将突出显示(彩色金色)。单击选定的原子,键或约束标记会将显示重置为分子属性。  
点击另一个分子可以显示该分子的分子特性。“属性”对话框中还提供了有关绘图和绘图样式和范围更改的信息,以及有关回归适合电子表格中数据的信息。  
在分子属于具有多于一个成员的列表的情况下,可以使用屏幕左下角的和按钮或滚动条来从列表中的不同成员中进行选择。或者,如果列表的电子表格在屏幕上打开,则可以通过单击电子表格左侧所需分子的名称来进行选择。  
单击屏幕左下角的动画显示列表中分子的显示,即按顺序逐步显示。这对于沿反应坐标显示图形表面的进展非常有用。单击(替换)将停止动画。  
可以一次显示来自相同列表的两个或更多个分子(尽管可以仅选择一个)。通过选中电子表格中分子名称右侧的框,标记分子以进行显示。  
更改颜色和设置首选项  
“选项”菜单下的“颜色和首选项”允许分别更改默认背景和图形对象颜色,以及设置(和重置)程序默认值。可以从“属性”对话框(“显示”菜单)中获取对分子特定部分的颜色(以及模型样式)的更详细控制。  
监视和终止作业  
“选项”菜单下的“监视器”允许监视正在执行的作业以及终止作业。

使用帮助

1、如何计算极化率?
斯巴达可以通过3种方式计算极化率:
使用下面描述的经验公式。这在属性面板的QSAR选项卡中可用,可用于所有量子力学级别。 (它可以在电子表格中显示“Polarizability = @ PROP(EST_POLARIZ)”功能)。
可以通过添加POLAR关键字的完整Spartan版本中的第一原理方法来计算极化率。有关如何获得频率相关极化率的信息,请参阅本常见问题解答的关键字部分中的POLAR =关键字。此计算的摘要将打印在输出文件中。有关更多详细信息,您可以使用KEEPVERBOSE关键字
当使用半经验方法时,可以使用POLAR关键字计算极化率。对于HF计算,该关键字还使用Kurtz在H.A.中描述的方法计算超极化率。 Kurtz等。 al。,J。Comp。提供了极化率和超极化率张量以及实验观察到的“平均极化率”(α),“第一超极化率”(β)和“平均第二超极化率”(γ)。 。
这些值将打印在输出中。应注意,在输出中,使用两个不同的方程来计算极化率。 (E4是能量方程,'dip'是偶极方程 - 来自Kurtz论文。)这些方法之间的主要区别在于对“舍入”误差的敏感性。差异可用作最终结果中不确定性的估计值。请注意,详细信息放在详细输出中,因此请确保使用KEEPVERBOSE关键字或在“首选项面板”中设置“保持详细”选项。
可以使用@PROP()可能的选项从电子表格访问这些值
POLAR_STATIC_ALPHA POLAR_STATIC_BETA POLAR_STATIC_GAMMA POLAR_STATIC_TENSOR和POLAR2_STATIC_TENSOR(18个元素)。
2、极化率的单位是多少?
在属性模块中计算的极化率来自经验公式:
  
电负性: - (E_HOMO + E_LUMO)/ 2
  
硬度: - (E_HOMO - E_LUMO)/ 2
  
极化率:0.08 * VdW_Volume
                     
-13.0352 *硬度+ 0.979920 *硬度^ 2
                     
41.3791
    
最后的单位是
      
10-30 m3
电子密度,自旋密度,偶极矩,电荷和静电势
为了获得更传统的coul2 * m / N单位,我们除以自由空间的介电常数(和4 *π),然后按比例缩放到适合原子尺度的单位。
要将“au”(通过量子计算计算)转换为coul2m / N(或coul2m2 / J),必须乘以
[1 / bohr] 3 * [4 *πεo] = [0.148185x10-30] * [111.21x10-12] = 16.4877x10-42
      
1 a.u. = 16.4877x10-42 coul2 * m / N.
      
1 a.u. = 0.148185 A3
      
1 a.u. = 0.148185 m-30
例如,一氧化碳的HF / 6-31 + G(2df)计算在垂直于分子轴的方向上产生“10”的极化率。与实验(2 + -0.5)公平一致,为1.65x10-40 coul2m / N.
这些条款来自哪里?
虽然这些系数可能看起来是任意的,但第一项是从假设所有原子都具有氢的极化性的估计得出的,并且从最高占据和最低未占分子轨道的能隙施加校正。这个等式仅用于半经验方法 - 事实证明这是一个相当不错的初步猜测。从一个新生物理教科书,答案应该是(对于原子组):电子密度,自旋密度,偶极矩,电荷和静电势

     H   0.66
     He   0.21
     Li  12
     Be   9.3
     C    1.5
     Ne   0.4
     Na  27
     Ar   1.6
     K   34

更新日志

版本1.1.4  
使用HESS=关键字重新启动作业的行为更好。  
更好地处理属性模块中损坏的档案。  
改进了对齐模块中的一些错误消息。  
在MacOSX下成功完成并行作业时解决了一些虚假/罕见错误。  
CSD搜索现在可在MacOSX上运行(适用于剑桥结构数据库许可证持有者)  
MacOSX上的固定文档选项卡标签(当前/所选文档显示为灰色的白色字体)  
现在可以在不重新启动程序的情况下打开ChemDraw界面。  
初始核苷酸构建体上升/扭曲值已更正。  
“新建草图”菜单快捷方式已更正。  
修复了草图构建入口时发生的崩溃错误。  
添加了SpectraView拟合功能。  

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