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用于药物开发的建模和仿真软件Lixoft monolix Suite 2023R1 (x64) x64

  • 软件大小:未知
  • 更新日期:2023-03-04
  • 官方网站:闪电下载吧
  • 软件等级:★★★☆☆
  • 运行环境:Winxp/Win7/Win8/Win10
用于药物开发的建模和仿真软件Lixoft monolix Suite 2023R1 (x64) x64
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Lixoft Monolix Suite 2023破解版是用于药理学分析、建模和模拟的统一应用程序套件,安装完成后包含五个独立的程序,它们功能各异,Datxplore是一款图形和交互式软件,专门用于数据的探索和可视化。PKanalix则是能够用于非房室和房室分析的图形和交互式软件。通过简单的工作流程提供了清晰的用户界面,可以高效地执行NCA和CA分析。Mxxplore是用于复杂药理模型探索和可视化的图形和交互软件。Monolix可用于非线性混合效应模型中的参数估计,模型诊断和评估以及高级图形表示。是基于模型的药物开发的参考平台。它结合了最先进的算法和独特的易用性。临床前和临床组的药师可以依靠Monolix进行人群分析,并为PK / PD和其他复杂的生化和生理过程建模。Monolix是用于非线性混合效应模型中的参数估计,模型诊断和评估以及高级图形表示的简便,快速且强大的工具。Monolix是由Inria(信息与自动化研究所)领导的十年统计和建模研究计划的结果,该计划涉及用于高级人群分析,PK / PD,临床前和临床的非线性混合效应模型试用模型。可根据您的数据和您要建模的现象来构建模型。它是一个强大的平台,可使用Mlxtran语言创建人类可读的模型描述,对模型进行图形化探索,与数据进行比较以及探索单个参数和协变量对结果的影响。Simulx是用于临床试验药理学的功能强大且灵活的模拟器。您可以使用Datxplore进行快速的数据探索,使用Monolix进行参数估计和模型诊断。使用库,宏或ODE进行模型定义。使用图形进行模型诊断和改进。使用Mlxplore进行模型探索以及使用Simulx模拟先验剂量发现,界面都非常的直观和友好,本次带来的是最新2023破解版下载,有需要的朋友不要错过了!

安装破解教程

1、在本站下载并解压,如图所示

2、安装程序,安装目录

3、勾选我接受协议

4、从破解文件夹复制lixoftCore.dll文件,并将其替换为C:\ProgramData\Lixoft\MoneolixSuite2023R1\lib

5、复制文件夹Crack并将其粘贴到C:\,运行 rlm.exe 

6、运行程序,如图所示,载入你的lic许可证,点击load

2023新功能

1、全球互操作性
*扩展的互操作性,可将PKanalix、Monolix或Simulx运行导出到MonolixSuite的任何其他应用程序。
除了现有的出口/进口,现在还可以:
-将PKanalix CA运行输出到Simulx,以预测这些相同的个体对另一种给药方案的反应。
-将Simulx运行或Monolix单独拟合或VPC模拟导出到PKanalix,以在模拟数据上运行NCA。
2、全局显示
*基于自定义Word模板文件自动生成报告的报告模块:
-占位符可以写入任何Word模板文件中,在生成报告时,它们将被PKanalix或Monolix运行的绘图和表格替换
-可以在GUI中为每个绘图和表格轻松生成占位符,然后将其复制到Word模板中
-可以自定义绘图和表格的占位符,以便在报告中显示所需的内容
*可以为观测数据和VPC图设置自定义轴限制。
*在“观测数据”图中,在同一图上,不同组的趋势线(平均值和标准误差)可以通过协变量分割后合并。
*现在可以直接从MonolixSuite的任何应用程序的界面发送软件反馈。
3、数据集
*接口中的数据格式化模块,使输入格式更加灵活。
从输入数据集(尚未采用MonolixSuite格式),现在可以:
-合并多个观测类型
-基于BLQ标签添加审查信息
-从外部文件中添加治疗信息,或手动指定多种可能性(多剂量方案、重复周期、输注、联合疗法、剂量取决于类别、使用剂量间隔等)
-从另一个文件中添加协变列和回归列
4、PKanalix公司
*[单位]数量列、每体重或体表面积的其他标准化单位。
*[CA任务]可以使用CA中的任何模型,使用mlxtran语法或从MonolixSuite库中自行编写。
*[CA任务]CA中的改进算法,以逃避更好的局部最小值并改进拟合(对于比标准pk更复杂的模型很重要)。
*[CA任务]基于广义最小二乘法的新成本函数,能够将模型与AIC和BIC进行比较。
*[CA任务]新加权选项1/|Ypred*Yobs|。
*[CA结果]单个参数表中报告了单个成本,新的成本选项卡显示了全局成本、-2LL、AIC和BIC的值。
*[CA图]对于CA,新的观察值与预测值绘制图以诊断拟合。
*[结果]其他汇总度量几何CV和调和平均值。
*[首选项]NCA参数名称和摘要度量名称的自定义别名,它们出现在表、图和报告中。
5、Monolix公司
*[结果]除了群体参数表中随机效应的标准差外,还报告了变异系数。
*[数据]顺序方法现在更容易了,因为来自另一次运行的PK参数可以直接在接口中作为回归函数添加到数据集(通过数据格式化模块)。
6、Simulx公司
*[结果]在表和图中,将个人的模拟ID映射到来自Monolix运行或用户定义的外部元素的原始标识符。
*[图]现在可以在同一图上合并不同组的模拟输出分布。
*[定义]导入Monolix运行后创建的新元素,以模拟共变或参数不确定性对典型个体的影响(omegas设置为零)。
*[结果]计算结果的更多后处理可能性,如
-低于、高于或在特定值之间的持续时间,
-自定义时间的输出值,
-相对于最小/最大值的标准化(除基线值外)
-将报告时间的结果定义为连续或事件类型
*[定义]一键将单个元素转换为群体元素,反之亦然。
*[绘图]设置视觉提示后,视觉提示自动切换到OFF。
7、Lixoft连接器/命令行
*新的Monolix连接器用于从R。
*新的Simulx连接器,用于定义和计算界面中的结果和端点。
*新的连接器覆盖了接口中可用的新功能(formatData、generateReport、getCACost)。
*新函数reportGenerator可直接从命令行生成报告。
*使用与GUI中相同的过滤器选择库模型的新连接器。
*改进了未识别参数时的错误和警告消息。
*Simulx连接器的大量文档,包括每个功能的详细描述和工作示例。
*setConsoleMode(在GUI中显示计算进度)现在也可用于Simulx和PKanalix。
8、更新:
*ODE求解器CVODE升级到5.5版。
9、修复的错误:
=====全球互操作性
*[export]已修复在共享驱动器上导出时文件导出速度慢的问题。
=====全局显示
*[观察数据]当去除点和线时,设置为始终可见的给药时间消失。
*[观察数据]轴限值基于点,即使点未显示在绘图上。
*[plots]对于所有绘图,“随机颜色”选项都不起作用(单击它时不会发生任何事情)。
*[观察到的数据]当一个图被拆分并分页时,图例在从一页转到另一页时没有正确更新。
*[libraries]从库中选择模型时显示的参数并不总是模型的输入参数。
=====数据集
*[数据解释]在一些非常特殊的情况下,当在CENS列中加载带有“1”的数据集时,它被认为是右删失而不是左删失。
*[协变量统计]分层协变量未出现在协变量统计选项卡中。
=====PKanalix公司
*[计算]即使对于不使用lambda_z的参数,也使用验收标准来筛选个体。
*[设置]如果选择了部分AUC,则无法从计算参数列表中删除任何部分参数。
*[结果]在个人评估表中,ID和场合显示为双倍,而不是整数。
*[data]PKanalix在重新加载数据集中使用Cc作为头的项目时崩溃。
*[首选项]有效数字不适用于结果表中的所有值(仅适用于当前显示的行)。
=====单片
*[检查初始估计值]除正态分布外的观察模型未被自动初始化算法正确处理。
*[统计模型]错误参数的名称基于加载模型后Monolix首先给出的默认观测名称,如果手动更改映射和观测名称,则不会修改这些名称。
*[统计模型]显示公式时,垂直滚动条消失。
*[plots/VPC]选择和取消选择“最后一次剂量后的时间”并没有使箱子恢复到相同的状态。
=====西克莫无花果
*在比较选项卡中,未显示RSE的NaN,单元格显示为空。
*当选择仅包含一个mlxtran文件的文件夹时,文件夹和“扫描”按钮不会出现。
=====模拟
*[模拟]只有一个时间段时,没有考虑到时间间的可变性。
*[结果]即使只有一个复制,结果中也会显示端点摘要选项卡。
*[结果]重命名结果与组比较摘要中的结果重复。
=====Lixoft连接器/命令行
*[getChartsData]getChartsData计算所有绘图的图表数据,即使请求了特定绘图。
*[defineTreatmentElement]通过协变量缩放治疗的选项在GUI中可用,但在连接器中不可用。
*[definePopulationElement]尝试使用多行设置填充参数元素时,出现崩溃而不是错误。
*[setGroupElement]将多个元素设置为同一模拟组时出错。
*[命令行]选项--如果使用选项“-t monolix”,则不考虑gui。
*[newProject]newProject无法使用modelFile=“lib:…”。
*[deleteOccasionElement]如果项目中不存在任何场合,deleteOccasonElement将删除mlx_Cov。
*[setData]setData(以及使用它的Rsmlx函数:bootmlx、confintmlx)在某些情况下未正确设置某些计算机上的数据,导致错误“观察类型和数据文件输入之间的观察名称不一致”。
*[define..Element]常见元素的场合定义没有适当考虑场合列。
*[getTreatmentElements]getTreatment Elements()返回了截断的行数。

功能特色

一、Datxplore
正确的数据预分析应用
Datxplore是用于数据探索和可视化的图形和交互式应用程序。Datxplore提供了各种图表和图形(箱形图,直方图,生存曲线等),以研究离散和连续数据的统计特性,并根据协变量,个体等来分析行为。
1、轻松进行数据可视化
Datxplore与协变量一起用于连续,离散和事件可视化。
2、轻松的数据操作
用户可以过滤,选择和拆分数据集中的数据。此外,用户可以重新创建类别以适合感兴趣的变量。
3、可视化所有类型的数据
连续
离散的
事件
4、协变量依赖关系可视化
箱线图,散点图可视化
协变量到协变量的依存关系
5、轻松的数据操作
用户可以选择,过滤和划分数据集的所有协变量。
二、PKanalix
PKanalix是用户友好的快速应用程序,用于隔室和非隔室分析(NCA)
1、非常直观的界面
可以通过图形界面使用PKanalix轻松定义设置和规则,检查计算并显示结果。也可以通过R将其用于强大的脚本编写。
2、简单的NCA
PKanalix使用行业标准方法计算NCA参数,并自动生成全套图以可视化数据,计算出的参数分布以及与协变量的相关性。
3、可靠清晰的结果
所有结果均以表格和摘要的形式提供,并以交互式图解的形式提供,以实现快速,直观的解释。所有设置都保存在项目中,以便获得可重复的结果,并且集成的验证套件可确保正确的安装和计算。
4、隔室分析
还建议使用较大的PK模型库来计算隔室分析框架中的参数。此外,它包括使用Monolix进行人口建模的直接链接。
5、非隔间分析
PKanalix的第一个主要功能是在非分区分析框架中计算参数。
该任务包括定义用于计算\ lambda_z(终端消除阶段的斜率)的规则,以便能够计算NCA参数。该定义既可以通过规则(例如,调整后的R2或时间窗口)全局完成,也可以在用户可以选择或删除任何计算点的个人上进行。
6、隔室分析
PKanalix的第二个主要功能是在Compartmental Analysis框架中计算参数。它在于寻找代表每个人隔室动力学的PK模型参数。自动初始化是为了使每个参数的每个参数更好地收敛。
7、输出和绘图
所有NCA和/或CA输出都显示在可排序的表中,并以R兼容格式导出到结果文件夹中。还建议使用交互式绘图来直接解释结果。
8、PKanalix,易用性和强大的计算能力
我们的解决方案旨在易于使用和快速设置要运行的分析。PKanalix可以通过图形界面或R使用,以进行强大的脚本编写。这意味着您无需进行任何编程,而将更多精力放在探索模型和解释结果以及时交付上。只需单击几下即可设置NCA或CA分析。表格和曲线图是自动生成的。可以轻松定制图。
三、Monolix
专为基于模型的药物开发计算而构建
Monolix是用于药理学的非线性混合效应建模(NLME)的最先进,最简单的解决方案。它基于SAEM算法,即使对于复杂的PK / PD模型,也可以提供强大的全局收敛性。Monolix用于临床前和临床人群PK / PD建模以及系统药理学。
Monolix拥有一个庞大的用户社区。 Monolix已被学术界,制药行业以及美国监管机构广泛使用。
1、先进的统计方法
对所有类型数据的可靠收敛是总体PKPD建模的核心,这就是Lixoft与Inria SAEM算法合作开创先河的原因。
2、自动生成诊断测试
Monolix即使对于复杂的PK / PD模型,也会自动生成全套诊断图。例如,您可以立即创建“视觉预测检查”,并按要调查的任何患者亚组划分。
3、提高生产力和质量
高效的C ++求解器程序包,带有Mlxtran的标准化模型语言,PK / PD模型库以及集成软件,均有助于提高生产率和质量。
4、非常易于使用的GUI
我们的解决方案旨在易于使用。可以通过图形界面或命令行使用Monolix进行强大的脚本编写。这意味着您无需进行任何编程,而将更多精力放在探索模型和药理学上,以便及时为您的客户提供服务。
5、支持所有相关数据类型和统计功能
Monolix涵盖了用于人口PK / PD建模的各种数据类型和统计功能。对于所有情况,已经开发出正确的统计方法并发布以供参考。Monolix涵盖:
对事件数据的连续,分类,计数和重复时间。
混合物模型和模型混合物。
不同级别之间的场合间差异。
正确处理BLQ数据。
各个参数的正态,对数正态,对数,对数,概率和用户定义的分布。
6、Mlxtran
Mlxtran用于定制模型。一种简单但功能强大的模型语言,适用于简单以及复杂的系统药理学模型。Monolix提供了一个完整记录的开源库,其中包含成千上万的PK和PD模型。
7、全面的文档和示例
我们已非常谨慎地为用户提供全面的文档,包括方法论,软件手册,教程等。
包含模型和数据的大量示例可以用作启动您自己的项目的模板。
8、使用Mlxtran构建模型 
Mlxtran用于定制模型;一种简单但功能强大的模型语言,适用于简单PK和复杂的系统药理学模型。模型文件包含结构模型,观察模型,单个参数定义和协变量定义。提出了一个Mlxtran语法的专用网站。
Mlxtran还包含一组用于PK / PD模型的宏和库。快速直观地定义模型非常有帮助。
9、Monolix,易用性和强大的计算能力 
我们的解决方案旨在易于使用。可以通过图形界面或命令行使用Monolix进行强大的脚本编写。这意味着您无需进行任何编程,而将更多精力放在探索模型和药理学上,以便及时为您的客户提供服务。界面很简单,只需几个步骤即可完成所有项目。
四、Mxxplore
轻松,交互式的高级模型探索
Mlxplore是用于可视化和交互式探索模型的应用程序。它旨在直观且易于使用。它是您日常建模工作以及PK / PD原理的共享和教学或在观众面前进行实时剂量方案探索时的强大解决方案。Mlxplore还允许您可视化模型的统计组成部分,例如协变量和个体间变异性的影响。
1、易于模型实施
Mlxtran用于定制模型编程。Mlxtran是适用于简单PK和复杂系统药理学模型的一种简单而强大的模型语言,  它包含一组用于PK / PD模型的宏和关键字。
2、研究设计的简单实施
治疗和给药可以由Mlxtran指定  。
3、强大的用户友好界面
Mlxplore提供了一个易于使用,灵活且完全交互的界面。它包括一个嵌入式文本编辑器,具有针对Mlxtran语言和Mlxplore项目的自动帮助和语法突出显示功能。
4、快速计算复杂模型
模型会在后台自动编译,以实现闪电般的快速仿真。Mlxplore不仅具有高效的ODE求解器,而且还支持延迟微分方程(DDE)。
5、轻松直观比较不同模型和不同剂量方案
交互式地可视化您的模型
定义复杂的管理方案
比较不同的模型和剂量方案
探索结构和统计模型的属性。
6、统计变异性的高级探索
可视化个体差异的影响
探索协变量及其影响
完全支持层次统计模型
预测分布和预测间隔。
7、与Monolix的双向链接。 
您可以在Mlxplore中构建模型,并在Monolix中使用它。但是,您也可以在Monolix中估计参数,并根据Monolix结果和数据集重新探索/改进模型。
8、模型文件构造
Mlxtran用于定制模型;一种简单但功能强大的模型语言,适用于简单PK和复杂的系统药理学模型。模型文件包含结构模型,观察模型,单个参数定义和协变量定义。提出了一个Mlxtran语法的专用网站。
Mlxtran还包含一组用于PK / PD模型的宏和库。快速直观地定义模型非常有帮助。点击查看更多。
9、项目建设
为了探索模型,有必要添加一些内容。必须添加图形的管理和处理,参数,感兴趣的变量,并可以选择预定义图形的一些选项(名称,顺序,…)。提出了一个专门的网站,用于Mlxplore文档。
10、模型探索
图形界面可实时查看模型结果。所有定义的参数均可使用滑块进行配置。值更改的效果在图形上立即可见,从而实现了良好的交互性。图形代表模型中定义的输出,并且可以以多种形式显示(每种输出有时间,一个输出有另一个,…)。此外,有可能进行一定数量的模拟,以表示个体间的变异性和/或协变量的影响,并将其表示在图形上。提出了一个专门的网站,用于Mlxplore文档。
五、Simulx
用于临床试验药理学的功能强大且灵活的模拟器。
Simulx是用于Lixoft模拟引擎之上的临床试验药理学的强大而灵活的模拟器。它涵盖了用于仿真的广泛数据类型范围,并链接到可立即使用的PK和PD库。它直接与Monolix连接以进行无缝的建模和仿真,并且是当今统计上最严格的解决方案。Simulx与mlxR结合使用,可以通过一个全面的R包获得,Simlx是由Inria开发的DDMoRe赞助的mlxR库,其中包含用于高级临床试验模拟的多个R函数。
1、完全集成用于基于模型的药物开发
体验用于基于模型的药物开发的正确工具。一口气进行数据探索,模型构建,参数估计和模拟-无需重写数据集,模型或参数。
2、易于使用
运行完整的仿真就像一行代码一样简单。这意味着您可以集中精力快速探索模型和不同的研究设计,以便及时交付给您的临床团队。
3、广泛的数据和统计场景
触手可及的所有数据类型的模拟:  连续,计数,分类,事件发生时间 
几个级别的可变性:包括患者之间和患者内部的可变性,以实现更真实的模拟
高效的ODE方程求解器:模型在后台自动编译,可实现闪电般的快速仿真
支持延迟微分方程
完全的仿真设计灵活性:定义所有仿真参数,包括剂量,观测值和协变量。
诸如适应性试验设计之类的高级需求很容易实现,从而使用户可以进行更真实的临床试验模拟。

使用说明

一、目标
Monolix的目标是执行:
非线性混合效应模型的参数估计
使用随机近似期望最大化(SAEM)算法估算总体参数的最大似然估计量,而无需对模型进行任何近似(线性化,正交近似等),
使用Hastings-Metropolis算法,计算条件模式,从条件分布中采样,以计算条件均值和各个参数的条件标准差
为最大似然估计器估计标准误差
选型与诊断
使用某些信息标准(AIC,BIC)比较几种模型
使用Wald Test测试参数
使用Pearson相关测试来测试相关
使用Shapiro检验检验分布的正态性。
使用Mlxtran语言轻松描述药理模型(PK,PK-PD,离散数据)
拟合优度图
二、易于使用的界面
可以通过图形用户界面(GUI)或命令行界面(CLI)使用Monolix进行强大的脚本编写。这意味着更少的编程,而更多地关注于探索模型和药理学以便及时交付。
三、定义数据集
1、数据集结构
数据集结构包含每个受试者的测量,剂量方案,协变量等……即所有收集的信息。数据必须为长格式,即每一行对应一个单独的一个时间点。不同类型的信息(剂量,观察值,协变量等)记录在不同的列中,这些信息必须用列类型标记(请参见下文)。列类型非常相似,并且与Nonmem软件使用的结构兼容(区别在此处列出)。当用户定义数据集中的每种列类型时,将指定此字段,如下图所示。

请注意,Monolix通常根据名称提供对列类型的初始猜测。
另外,我们还有一个按钮DATA VIEWER,它可以浏览作为Datxplore的数据集。
列类型说明
数据集的第一行必须是标题行,用于定义列的名称。列名称是完全免费的。在MonolixSuite应用程序中,在定义数据时,将要求用户将每列分配给一个列类型(有关此步骤的示例,请参见此处)。列类型将向应用程序指示如何解释该列中的信息。可用的列类型如下:
用于所有类型的线的列类型:
ID(必填):个人的标识符
OCCASION(以前称为OCC):场合的标识符(索引)
时间:剂量或观察记录的时间
DATE / DAT1 / DAT2 / DAT3:剂量或观察记录的日期,与TIME列结合使用
EVENT ID(以前的EVID):用于指示该行是剂量线还是响应线的标识符
IGNORED OBSERVATION(以前为MDV):忽略该行的OBSERVATION信息的标识符
IGNORED LINE(从2019版本开始):忽略该行所有信息的标识符
连续变量(以前称为COV):连续协变量(可以采用连续标度的值)
类别协变量(以前称为CAT):类别协变量(只能接受有限数量的值)
REGRESSOR(以前为X):定义回归变量,即可以在结构模型中使用的变量(例如用于时变协变量)
IGNORE:忽略所有行的该列信息
用于响应线的列类型:
观察(强制性,以前是Y):记录连续/计数,分类或事件发生时间数据的测量/观察
OBSERVATION ID(以前的YTYPE):观察类型的标识符(以区分不同类型的观察,例如PK和PD)
CENSORING(以前称为CENS):标记审查的数据,低于定量下限或上限
LIMIT:在“ CENSORING”列的情况下,检查间隔的上限或下限
用于剂量线的列类型:
AMOUNT(以前称为AMT):剂量
ADMINISTRATION ID(以前称为ADM):剂量类型的标识符(例如,通过不同的途径给出)
输液速率(以前称为RATE):给药速率(特别用于输液)
输液时间(以前是TINF):给药时间(特别是用于输液)
附加剂量(以前为ADDL):除规定剂量外,还要间隔一定时间增加剂量
INTERDOSE INTERVAL(以前为II):使用其他剂量或稳态状态列类型添加的剂量的剂量间隔
STEADY STATE(以前的SS):表示已达到稳态,并且将在间隔INTERDOSE INTERVAL之前在实际剂量之前添加预定义的剂量数,以实现稳态
2、加载新数据集
要加载新数据集,您必须转到“浏览”数据集(绿色框),标记所有列(紫色框),定义观察类型,然后单击蓝色按钮ACCEPT,如下所示。

3、观察类型
观察分为三种类型
连续的:观察是相对于时间的连续的。例如,浓度是连续观察。
计数/类别:观察值发生在有限的类别空间中。例如,该观察可以是分类观察(可以观察到效果为低,中,高),也可以是在定义的时间内进行计数(在定义的时间内癫痫发作的次数)。
事件:观察是一个事件,例如发生癫痫危机。
观察类型可以由用户在界面中指定。
4、贴标
图和数据选择中建议的名称是标签中定义的名称。用户可以修改它。默认情况下,使用的标签是数据集中定义的标签。
从2019版本开始,可以更改您的首选项。通过单击设置>首选项,将弹出以下窗口。

在DATA框中,您可以为每列添加或删除首选项。
要删除首选项,请双击要删除的首选项。将提出一个确认窗口。
要添加首选项,请单击您考虑的标题类型,在标题名称中添加一个名称,然后单击“ ADD HEADER”,如下图所示。

注意,所有首选项在Monolix,Datxplore和PKanalix之间共享。
5、筛选
从2019年版本开始,我们添加了使用页面底部的过滤器以图形方式过滤数据集的可能性。

请注意,这只是一个图形过滤操作,它不会过滤Monolix使用的数据集。 用户可以在任何列和任何列组合上建议过滤器。它允许使用非常有趣的快捷方式直接在您的数据集中查看,而无需直接重新打开它。
此外,链接对象的每个连续信息,并显示协变量的摘要以及id值。而且,可以扩展或缩回对象的所有信息。
6、从Datxplore或PKanalix导入项目
可以从Datxplore  或PKanalix导入项目。为此,请转到Project> Datxplore / PKanalix的新项目(如下图的绿色框中所示)。在这种情况下,将创建一个新项目,并且所有DATA框架都已经被Datxplore或PKanalix  项目中的信息所填充。
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