CLC Genomics Workbench12破解版下载|生物信息学软件包 CLC Genomics Workbench 12.0.3-闪电下载吧

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CLC Genomics Workbench 破解版是一款功能强大的支持您日常生物信息学工作的软件包。它集合了基因组学工作的所有工具，在一个程序中用于基因组学、转录组学、表观基因组学和宏基因组学的完整工具包，并且继承到单个的界面友好且可扩展的应用程序中，旨在帮助用户快速生成准确的可信赖的结果，CLC Genomics Workbench由尖端技术和加速算法提供支持，支持一整套NGS数据分析应用程序。具有改进的NGS读取处理能力和集成的生物医学工作台功能,工作流可以将质量控制步骤，适配器修整，读取映射，变体检测以及多个过滤和注释步骤组合在一起，形成一个管道，您可以与同事共享并单击即可执行。本次带来最新CLC Genomics Workbench12破解版下载，有需要的朋友不要错过了！

软件功能

1、重新排序

CLC Genomics Workbench支持完整的重测序流程，用于检测和比较遗传变异。处理大量样品时，高效的算法可减少运行时间，而可定制的分析工作流程和批处理则可将动手时间缩短到最小。

CLC Genomics Workbench允许您专注于对检测到的变异的生物学解释。

2、读取映射

重新排序的第一步是准确的读取映射。我们的算法经过优化，可以快速，高效地存储大量数据，以进行高质量的映射。

该算法为各种数据格式提供了全面的支持，包括短读取和长读取，以及成对读取数据的所有形式，无论插入大小或读取方向如何。它还支持使用混合数据集。局部重排可以大大降低某些变体类型的假阳性检测率。我们的目标是减少您的手工工作，并专注于从原始NGS读数中获得生物学上有意义的结果。

3、转录因子ChIP-Seq

即使在没有对照样品的情况下，最新的改进也有望对转录调控有更深入的了解。转录因子ChIP-seq暴露了整个基因组中转录结合位点的特征峰区域。通过我们久经考验且受信任的交互式图形用户界面，所有这些都可以访问。

4、亚硫酸氢盐测序

胞嘧啶甲基化可能是表观遗传调控基因表达的最佳研究形式。用于CLC基因组学工作台的Bisulfite测序插件可为科学家在研究胞嘧啶甲基化数据时面临的常见问题提供一站式解决方案。

5、工作流程

工作流将所选工具简化为一项分析。工作流可以批量运行，使其成为功能强大的工具，可在最少的用户干预下处理大量样品。您可以按照自己的科学出版物轻松地设置自己的工作流程，并与同事或其他研究人员创建并共享工作流程安装程序文件。商业附加组件引入了预配置的示例工作流程，以使您从数据到发布的速度更快。

6、de novo

我们值得信赖的de novo汇编器，并带有修整工具，可删除低质量的数据，从而快速提供汇编质量并有效地利用计算资源。就像我们的读取映射器一样，支持多种NGS数据类型，并且混合程序集结合了短读取和长读取的独特优势，从而获得了最佳结果。如果长读段的组装（例如PacBio）或基因组整理是主要重点，那么可以使用商业CLC基因组整理模块来增强CLC Genomics Workbench 。

7、RNA序列

免费的“ Advanced RNA-Seq插件”将所有分析步骤（从读数的二次分析到复杂的统计数据）集成到易于使用的工作流程中，并提供了从案例控制或多重分析等多种实验设计的访问权限组实验到多因素实验。所有工具都考虑了由于测序深度而引起的差异，从而无需对输入数据进行标准化。用于批次效应的多因素统计控制，并支持配对研究。统计结果可以在基因组环境中显示为轨迹，表视图或通过许多利用元数据的可视化选项进行可视化：火山图，二维热图，主成分分析和维恩图。

8、组蛋白ChIP-Seq插件

组蛋白的乙酰化是重要的表观遗传适应，与染色质去浓缩和基因表达上调或下调有关。用于CLC基因组学工作台的Histone ChIP-Seq插件可检测基因或其他预定义基因组区域中Histone乙酰化标记的证据。

9、变异分析

CLC Genomics Workbench提供了一系列准确的变体检测器，可检测单核苷酸变体（SNV），多核苷酸变体（MNV），中小尺寸的插入，缺失或替换以及大型结构变体。仅由一小部分映射读物支持的灵敏检测所谓的“低频”变异的算法就构成了检测工具。为了使检测出的变异有意义，CLC Genomics Workbench提供了一系列过滤器和比较工具。

10、元基因组学

发现微生物群，其元基因组和宿主之间的关键相关性。通过用于分类学和功能性微生物组分析的工具和简化的分析工作流程，可以轻松了解复杂的宏基因组学数据。借助诸如CLC微生物基因组学模块（超链接）之类的商业附加产品，工作台成为微生物学家的领先解决方案。

11、还有更多功能：

使用CLC Genomics Workbench，您可以享受更多属于每个生物信息学专家库的工具。享受丰富的系统发育工具集，创建自己的BLAST搜索，设计PCR或实时PCR引物，并利用分子生物学工具开发10年的优势。

软件特色

1、适合所有人的基因组学工作台

CLC Genomics Workbench是一个功能强大的解决方案，适用于每个人，无论工作流程如何。利用尖端技术，独特功能和算法，工业界和学术界的科学领导者广泛使用该技术来克服与数据分析相关的挑战。

2、全面的NGS数据分析

用户友好的生物信息学软件解决方案可对NGS数据进行全面分析，包括整个基因组和从头组装转录组，有针对性的重测序分析，变异调用，ChIP-seq和DNA甲基化（亚硫酸氢盐测序分析）。

发现微生物群，其元基因组和宿主之间的关键相关性。通过用于分类学和功能性微生物组分析的工具和简化的分析工作流程，可以轻松了解复杂的宏基因组学数据。

受支持的NGS平台是Illumina，IonTorrent，PacBio和GeneReader。

RNA-seq和小RNA（miRNA，lncRNA）转录组学工作流程，用于在基因和转录本水平进行差异表达分析。

3、新增：生物医学基因组学分析1.0

在CLC Genomics Workbench上安装此插件可提供以前通过运行Biomedical Genomics Workbench并安装现已淘汰的插件QIAseq Targeted Panel Analysis可获得的功能。获得对生物医学即用型工作流程，QIAseq分析工具和工作流程或GeneRead分析工具和工作流程的访问权限。

用于人类，小鼠和大鼠基因组的生物医学工作流程包括遗传性疾病工作流程（三重分析）和用于FFPE或液体活检的肿瘤学体细胞突变检测工作流程（单个样品或肿瘤正常匹配的样品），包括对SNP，MNV，InDels，Tandem的灵敏检测重复序列，结构变体，融合基因和CNV。包括带有保守性分数的注释和dbSNP，ClinVar上的过滤步骤。

4、在人类疾病研究中发现导致突破性发现的信号

现在，可通过CLC Genomics Workbench和免费插件Biomedical Genomics Analysis提供生物医学基因组学分析和面板数据分析功能。这些一起替代了Biomedical Genomics Workbench，以及插件QIAseq靶向面板分析和QIAGEN GeneRead Panel Analysis插件。

5、即用型工作流程

通过Biomedical Genomics Analysis插件访问即用型工作流程。

现有生物医学基因组学工作台用户熟悉的即用型工作流程已得到改进和更新。现在，CLC Genomics Workbench 12版本中的所有用户均可使用它们。
6、领导自己的发现

修改工作流和发现参数，以假设为导向的分析将指导您获得最有希望的突破。

7、发现更多，更快

简单性，灵活性和准确性相结合，可为您提供比开源替代方案快50％以上的解决方案，并具有得到全面支持的附加优势。

8、定制的工作流程可加速您的数据分析

CLC基因组学工作台的开发旨在支持各种NGS生物信息学应用。工作流可以将质量控制步骤，适配器修整，读取映射，变体检测以及多个过滤和注释步骤组合在一起，形成一个管道，您可以与同事共享并单击即可执行。

安装破解教程

1、在本站下载压缩包，解压后得到CLCGenomicsWorkbench_12_0_64.exe安装程序和crack破解文件夹

2、双击CLCGenomicsWorkbench_12_0_64.exe运行安装程序，勾选我接受协议

3、选择软件安装路径，点击next

4、安装完成，退出向导

5、将crack中的文件复制到安装目录中，运行Loader，勾选导入许可证选项

6、选择license.lic，点击next

7、勾选接受协议选项，点击finish

使用帮助

一、用户界面

本章概述了CLC Genomics Workbench用户界面中的不同区域。从图2.1可以看出：

一个导航区域，其中的文件进行排序;

可以这样打开的工具箱，或者可以是“进程”或“收藏夹”选项卡打开的工具箱；

打开一个或多个标签的查看区域；

一个侧面板在有可能改变当前打开的视图设置;

一个菜单栏来访问各种功能和工具栏，突出最常见的行为;

一个状态栏在屏幕底部，指示是查看相关的工作台的状态（正在处理作业或闲置）和其他信息。

二、数据管理和搜索

本章介绍CLC Genomics Workbench的数据管理功能。第一部分解释了数据组织和导航区域的基础。下一节将说明如何为可用于更高级数据管理的数据设置自定义属性。最后，有一节介绍如何搜索本地数据。

1、导航区

在导航区域（见图 3.1）用于组织和导航数据。它的行为类似于文件和文件夹通常在计算机上显示的方式

图像导航区

带有数据列表的区域正上方是4个图标。从左到右，这些是：

折叠所有（图片塌陷_16_n_p）。这将关闭导航区域中所有打开的文件夹。

添加文件位置（图片添加位置）。添加位置中对此进行了说明。

“创建文件夹”图标（图片new_folder），用于在已配置的文件位置中创建新文件夹。

“全部更新”图标（图片刷新_16_n_p），刷新导航区域的视图。

要提供更多的空间来查看数据，您可以通过单击导航区域右上角的隐藏图标（）来隐藏导航区域和工具箱图片sidepanel_left_16_n_p。
三、导入/导出数据和图形

CLC Genomics Workbench处理大量不同的数据格式。为了在工作台中处理数据，必须将其导入（图片Next_Folder_16_n_p）。工作台无法识别的数据类型将作为“外部文件”导入，这意味着当您打开这些文件时，它们将在计算机上针对该文件类型的默认应用程序中打开（例如，Word文档将在Word中打开）。

本章首先讨论以生物信息数据格式和作为外部文件的数据的导入和导出。接下来是有关如何将图形数据点导出到文件以及如何导出图形的说明。
1、标准进口

CLC基因组学工作台具有用于宽范围的生物信息学数据如分子，序列比对等查看在的数据格式的完整列表的支持的数据格式列表。

可以通过“导入”对话框使用拖放或复制/粘贴来导入这些数据，如下所述。

有关NGS数据的导入，请参见导入高通量测序数据。有关轨道的导入，请参见导入轨道。

使用导入对话框导入

要使用导入对话框开始导入：

点击图片Next_Folder_16_n_p工具栏中的导入（）

然后选择标准导入

这将显示一个类似于图6.1的对话框。您可以通过在“ 文件类型”框中选择一种文件格式来更改应显示的文件类型。

图片导入对话框

图6。1：导入对话框。

接下来，选择一个或多个要导入的文件或文件夹，然后单击“ 下一步”以选择一个保存结果文件的位置。如果导入一个或多个文件夹，该文件夹的内容将自动导入并放置在导航区域中的该文件夹中。如果文件夹包含子文件夹，则将导入整个文件夹结构。

在导入对话框中（图 6.1），有三个导入选项：

自动导入

这将导入文件， CLC Genomics Workbench将尝试确定文件的格式。根据文件扩展名（例如，SwissProt文件的文件名末尾带有.swp）以及对文件中特定于各个文件格式的元素的检测来确定格式。如果无法识别文件类型，则将其导入为外部文件。在大多数情况下，自动导入将产生成功的结果，但是如果导入错误，则下一个选项可能会有所帮助：

强制导入为类型

如果CLC Genomics Workbench无法成功确定文件格式，则应使用此选项。通过将导入强制为特定类型，可以绕过自动确定文件格式的操作，并以指定的类型导入文件。

强制导入为外部文件

如果将文件作为外部信息导入为生物信息学文件，则应使用此选项。它可以是作为序列导入的普通文本文件。

使用拖放导入

也可以将文件从例如桌面拖到CLC Genomics Workbench的导航区域中。这等效于使用上述自动导入选项导入文件。如果无法识别文件类型，则将其导入为外部文件。

使用复制/粘贴文本导入

例如，如果您有一个文本文件或浏览器，以一种可以通过CLC Genomics Workbench导入的格式显示序列，则有一种非常简单的方法可以将该序列导入“ 导航区域”：

从文本文件或浏览器复制文本 | 在导航区域选择一个文件夹 | 贴上（图片贴_16_n_p）

这将基于复制的文本创建一个新序列。此操作等效于将文本保存在文本文件中并将其导入CLC Genomics Workbench。

如果序列未格式化，即如果您只有这样的文本：“ ATGACGAATAGGAGTTCTAGCTA”，您也可以将其粘贴到导航区域中。

注意！确保复制所有相关文本-否则 CLC Genomics Workbench可能无法解释文本。