CLC Genomics Workbench是一个综合分析包，用于分析和可视化来自所有主要的下一代测序（NGS）平台的数据。在一个程序中用于基因组学，转录组学，表观基因组学和宏基因组学的完整工具包！该工作台支持并无缝集成到典型的NGS工作流程中。CLC Genomics Workbench融合了最先进的技术和算法，在基因组学，转录组学和表观基因组学研究领域中支持关键的下一代测序功能。此外，它包括CLC Main Workbench的所有经典分析工具。适用于每个人，无论工作流程如何。工业界和学术界的科学领导者广泛使用的尖端技术，独特功能和算法使轻松克服与数据分析相关的挑战成为可能。全新破解版下载，含破解补丁文件和许可证文件，有需要的朋友不要错过了！
安装激活教程
1、在本站下载并解压，如图所示
2、双击CLCGenomicsWorkbench_21_0_2_64.exe运行安装，勾选我接受协议
3、选择软件安装路径
4、安装完成，不要启动程序，退出向导
5、替换补丁
6、管理员身份运行程序，勾选important a license from a file选项
8、点击如下按钮，选择CLC-LICENSE-CLCGENOMICSWB.lic许可证文件即可
9、对于插件，管理员身份运行程序，点击help-plugins
软件功能
1、全面的NGS数据分析
用户友好的生物信息学软件解决方案可对您的NGS数据进行全面分析，包括整个基因组和转录组的从头组装，重测序分析（WGS，WES和目标面板支持），变异调用，RNA序列，ChIP序列和DNA甲基化（亚硫酸氢盐测序分析）。
使用易于使用的转录组学工作流程分析您的RNA-seq和小RNA（miRNA，lncRNA）数据，以便在基因和转录本水平进行差异表达分析。
受支持的NGS平台包括Illumina，IonTorrent，Oxford Nanopore和PacBio。
2、生物医学基因组学分析
QIAGEN CLC Genomics Workbench和免费插件Biomedical Genomics Analysis提供了生物医学基因组学分析和面板数据分析功能。该插件提供了用于NGS面板数据分析的工具和工作流程，包括WES，WGS和RNA-seq，以及用于QIAseq和Ion AmpliSeq的SARS-CoV-2面板分析工作流程。
3、即用型工作流程
具有针对人类，小鼠和大鼠基因组的完整参考集的生物医学工作流程包括遗传性疾病工作流程（三重分析，四口之家）和肿瘤学体细胞突变检测工作流程，可用于FFPE或液体活检样品（单个样品或肿瘤样本）。正常匹配的样本）。这些工作流程能够灵敏地检测SNP，MNV，InDel，串联重复序列，结构变体，融合基因和CNV。包括带有保守评分的注释以及dbSNP和ClinVar上的过滤步骤。
4、用插件扩展工具箱
QIAGEN CLC Genomics Workbench提供了多个插件，可针对特定应用进行量身定制，例如多序列比对，全基因组比对，转录本发现，生物医学基因组分析，长期阅读分析和单倍型调用*。这些功能丰富的扩展已无缝集成到QIAGEN CLC Genomics Workbench中，并提供了高级工具和工作流，可满足您的特定分析需求。
5、在生物医学研究中发现导致突破性发现的信号
Biomedical Genomics Analysis插件还提供了对基于人类和小鼠基于PCR的GeneRead面板或基于独特分子索引（UMI）的miRNA，RNA，DNA和甲基化QIAseq面板对NGS数据进行分析的支持。这些工具和工作流程也可以与第三方供应商的NGS面板（PCR，UMI或混合捕获目标富集面板，例如Illumina TSO500，Ion Torrent，ArcherDx，Agilent，NimbleGen或Twist面板）配合使用。
6、不要相信我们的话：听听客户的意见
QIAGEN CLC Genomics Workbench已为成千上万的科学文章做出了贡献，并且是迄今为止分子生物学家和生物医学专业人士被引用最多的科学软件之一。
7、提高您的生产力是我们的业务。
QIAGEN CLC Genomics Workbench允许缩放到任意大小。企业解决方案允许整个机构使用相同的软件。
8、定制的工作流程可加速您的数据分析
QIAGEN CLC Genomics Workbench的开发旨在支持各种NGS生物信息学应用。工作流可以将质量控制步骤，适配器修整，读取映射，变体检测以及多个过滤和注释步骤组合在一起，形成一个管道，您可以与同事共享并单击即可执行。
新的工作流程元素以及增强的元数据功能允许在工作流程内进行批处理，例如对迭代许多RNA-seq样本的量化然后进行组的统计比较很有用。
9、使用QIAGEN Digital Insights从样本到洞察
通过QIAGEN CLC Genomics Workbench，您可以轻松访问许多物种的预格式化参考数据集。您还可以将结果提交给QIAGEN Digital Insights产品组合中的其他解决方案，例如，创想途径分析（IPA），QIAGEN Clinical Insights解释（QCI）和QIAGEN Clinical Insights解释翻译（QCI-IT）。
使用帮助
数据结构
导航区域中的数据被组织为多个位置。工作台数据位置表示计算机上的一个文件夹：在导航区域中工作台位置下显示的数据存储在计算机上，该位置指向该文件夹中。
这在图3.2中进行了直观的说明。通过将鼠标悬停在数据位置文件夹图标上可以看到系统文件夹的完整路径，如图3.3所示。
图3.2：在此示例中，名为“CLC_Data”的位置指向C：Users<用户名>CLC_Data处的文件夹。
图3.3：将鼠标悬停在名为“CLC_Data”的位置上会显示系统文件夹的完整路径，本例中为C：Users<用户名>CLC_Data。
首次启动CLC Genomics Workbench时，将存在一个称为CLC_Data的位置，这是默认的数据位置（除非您的计算机管理员另行配置了安装）。也将有一个称为CLC_References的位置。
CLC_References位置用于存储使用参考数据管理器下载的基因组参考和相关数据，如参考管理中所述。
保存在CLC服务器上的数据
如果已从工作台登录到CLC服务器，则存储在CLC服务器上的数据也将在工作台导航区域中列出，如图3.4所示。
图3.4：CLC服务器上的数据区域在导航区域中以蓝色方形图标突出显示。
2、建立新资料夹
为了整理您的文件，可以将它们放在文件夹中。创建新文件夹的方法有两种：
右键单击导航区域|中的元素。新增|资料夹（）
或文件|新增|资料夹（）
如果在添加新文件夹时在导航区域中选择了一个文件夹，则新文件夹将添加到该文件夹的底部。如果选择了一个元素，则新文件夹将添加到该元素的正上方。
您可以通过选择文件夹并将其拖动到所需的位置来手动移动文件夹。
3、文件夹排序
您可以按字母顺序对文件夹中的元素进行排序：
右键单击文件夹| 排序资料夹
在Windows上，子文件夹将放置在文件夹的顶部，其余元素将按字母顺序在下面列出。 在Mac上，子文件夹和其他元素都按字母顺序列出。
4、多选元素
多选元素意味着您同时选择多个元素。 可以通过以下方式完成此操作：
在多个元素上单击的同时按住<Ctrl>键（在Mac上），选择已单击的元素。
选择一个元素，然后在按住<Shift>键的同时选择另一个元素，将选择两个位置（包括两个末端位置）之间列出的所有元素。
选择一个元素，然后在按住<Shift>键的同时使用箭头键移动光标，可以增加所选元素的数量。
更新日志
QIAGEN CLC基因组学工作台21.0.2
改进和错误修复
修复了一个问题，该问题导致无法使用包含其他限制酶的已保存视图设置（通过侧面板设置进行配置）。当将已保存的视图设置直接应用于打开的序列或序列列表时，或者在工作台首选项中通常将此类视图设置应用于序列时，此问题可能导致出现错误消息。
修复了保存该视图设置时未保存通过序列的侧面板设置对主题列表所做的更改而未保存的问题。
解决了以下问题：对数图上的轴缩小到指标之间存在多个数量级的点时，可能会显示错误的值。
修复了无法在配对上定义条形码的配对读取上运行在工作流上下文中运行的多路复用读取的问题。
各种小改进
