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科学图像处理 ORS Dragonfly 2022.2.0

  • 软件大小:未知
  • 更新日期:2023-02-10
  • 官方网站:http://www.theob<x>jects.com
  • 软件等级:★★★☆☆
  • 运行环境:Winxp/Win7/Win8/Win10
科学图像处理 ORS Dragonfly 2022.2.0
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Dragonfly破解版是科学图像处理的首要软件平台!Dragonfly功能强大、灵活且用户友好,可为当今要求最苛刻的2D/3D/4D成像研究提供定量答案,包括来自相关和高光谱成像系统、X射线、SEM、FIB-SEM、离子束和共聚焦显微镜以及其他高级应用的数据。Dragonfly 2022.2和Dragonfly Pro 2022.2的软件发布标志着特征分析的首次集成,用于执行特征向量和其他测量的交叉表分析。值得注意的其他新功能包括弹性配准,以更好地了解数据集是如何变形的,预训练的深度学习模型,以加速模型训练,深度模型训练或推断之前数据范围的标准化,以及表征材料财产和测量骨密度的新测量。Dragonfly 2022.2还包括对分割向导、CT重建和Movie Maker的显著增强,以及新的3D渲染功能和优化。

功能特色

1、数据导入
Dragonfly是将来自多个来源的数据集成到单个环境中的理想框架,无论您的图像来自领先的显微镜和成像硬件供应商,还是由学术软件生成的RAW文件。
映像堆栈(.tif*、.tiff*、.jpeg、.jpg、.png、.bmp.dib扩展)。
DICOM图像文件(扩展名为.dcm)。
MRC(.mrc扩展名)、REK(.rek扩展名)、TXM**(.txm扩展名)、CZI***(.czi扩展名)。
带或不带头文件(.dat扩展名)的RAW数据(.raw和.pic扩展名)。
分析7.5文件(.hdr扩展名和附带的.img扩展名)。
支持与时间相关的数据和RGB图像。
支持来自EDS,EELS,SIMS,EBSD-成像系统和叠层扫描(.am,.dm3,.dm4扩展名和.h5用于pycroscopy)的高光谱和超维图像。仅限测试版。
2、可视化
Dragonfly提供了一套功能强大的图像审查和交互式检测工具,可让您详细了解3D数据。
在融合视图中或跨多个场景视图显示多个数据集。
在工作区中同步2D和3D视图,以便于不同数据集的并排比较。
MIP、mIP和平均强度投影中的MPR、斜视图和双斜视图。
时间相关数据和超维图像的可视化*。*仅限测试版。
具有照明、透明度、优化预设和分段化的实时高质量3D体积渲染。
带有比例尺的正交视图,可更好地了解对象。
使用焦点和景深控件清晰定义感兴趣的对象或特征。
操作工具包括“轨迹”、“窗口级别”、“平移”、“电影”、“缩放”和“行走”。
裁剪工具,用于在3D视图中沿正交平面以交互方式裁剪图像数据、感兴趣区域、多ROI和网格。
视觉平面工具,用于在任何任意平面中交互式裁剪图像数据、感兴趣区域、多ROI和网格。
应用视觉效果(如查找表功能、边缘对比度和窗口调平)来增强3D可视化效果。
编辑和创建查找表函数。
使用共同定位的“不透明度设置”控制台快速调整2D和3D视图中可见的所有对象的不透明度。
2D和3D视图的可选背景颜色。
3、注释和测量
用于向2D和3D视图添加注释以及从图像数据和处理对象中提取测量值的工具包括:
将图像和文本叠加添加到2D和3D视图以说明结果。
用于测量长度、角度、柯布角度和面积的基本工具。
用于提取多个强度和位置的点工具。
区域和深度探测工具,用于从数据集、多ROI和网格中提取测量值。
使用点探头、线和路径剖面以及区域内剖析强度分布。
将平均模式应用于垂直于圆盘或正方形内的直线或路径的剖面强度。
定义路径以提取有关弯曲结构的信息。
为数据集中的每个剖切片和整个数据集计算任意倾斜的测量范围。
在感兴趣区域的任何倾斜惯性矩、平均厚度和周长下进行每片测量。
感兴趣区域、多ROI和网格的费雷特直径测量(最小值、平均值、最大值)。
感兴趣区域的统计属性,包括体积、表面、费雷特直径、比较体积和相关强度。
感兴趣区域的各向异性测量(MIL和SVD)。
4、图像处理
Dragonfly中可用的后处理功能包括数据重组、配准以及2D、3D和4D拼接。
CT重建模块,用于锥形束和平行束投影的断层扫描重建(仅限测试版)。
根据不同的分析需求裁剪数据集、反转数据、重构数据。
修改图像间距并调整数据偏移和斜率、空间位置和方向。
应用阈值操作以提取新数据集或等值线网格。
将所选数据集的直方图规范化为引用的直方图。
插入或删除数据集中不具代表性的图像切片。
从标记的图像切片创建新数据集。
使用修复快速删除小缺陷或替换图像数据丢失或损坏的部分。
自动匹配过程,以对齐切片并构建一致的图像堆栈。
具有自动和手动注册选项的多模态融合。
通过将应用于引用对象的转换应用于其他数据集来保持多个对象的一致性。
自动对齐选定对象的质心,包括图像数据、感兴趣区域、多ROI和网格,并带有参考。
图像拼接以组合或拼接2D/3D图像图块以创建单个高分辨率图像。
将多个体积数据集合并或拼接为单个3D数据集。
将多个体积数据集合并或拼接为单个4D数据集。
5、图像处理(过滤)
Dragonfly广泛的图像处理工具包具有过滤器,可平滑图像、锐化边缘、校正不均匀阴影、提取特征等。通过可选择的2D和3D设置以及用户指定的内核大小,您可以将多个过滤器组合在一起作为工作流程,这些过滤器可以保存并应用于一批图像以进行自动化处理。
梯度域融合滤波器,用于从已注册的图像堆栈中删除图像间不连续性。
环形伪影删除过滤器。
任意角度、水平和垂直去条带化滤镜。
针对经过训练的深度学习模型的全面过滤(去噪、分割、图像增强)。
对比度调整(CLAHE、直方图均衡、局部直方图均衡、斜率图滤波器)。
使用归一化滤波器进行动态范围扩展。
用于检测容器状或管状结构和纤维的过滤器(鸡蛋花、黑森过滤器)。
边缘增强(坎尼、高斯差分、拉普拉斯、普雷维特、沙尔、索贝尔滤波器)。
用于在频域中工作的滤波器(离散傅里叶变换、离散逆傅里叶变换)。
形态操作(扩张、侵蚀、打开、关闭、顶帽变换)。
用于分段的筛选器(K均值、小批量K均值)。
阴影补偿(直方图平衡、手动RBF*、多项式滤波器)。
锐化(高斯高通,非锐化滤波器)。
平滑(各向异性扩散、双边、高斯、利普希茨、均值、均值、均值偏移、中位数、非局部均值*、百分位数、小波和秩滤波器)。
纹理分析(Gabor、图像时刻、局部二元图案、膜投影过滤器)
阈值(自适应、自适应高斯、等值数据、Li、局部Otsu、平均值、最小值、Niblack、Otsu、Sauvola、三角形、日元滤波器)。
通过算术运算创建新数据集。
使用渐变和发散过滤器提取有关强度值变化的信息。
通过使用自定义2D或3D内核卷积图像来创建您自己的滤镜效果。
通过应用保存的图像过滤工作流程来加速重复的后处理任务。
在选定的操作中处理多比例图像,并为输出选择不同的几何形状和数据类型。
6、分割
借助Dragonfly中的图像分割和直观的遮罩操作,您可以快速识别和标记感兴趣的区域,从而详细了解材料结构和属性。
分割向导,它提供了一个易于使用的引导式工作流程,用于实现多维图像的深度学习和经典机器学习分割。
深度学习解决方案,用于开发新的神经网络,还可以训练、重用和重新调整现有模型的用途,以执行分割任务。
高级机器学习插件,允许您在有限的样本中训练分类器,以便它学习如何分割整个数据集或其他类似数据集的像素。
活动等值线工具,用于从所选路径生成感兴趣区域、多ROI和曲面网格。
交互式阈值、分区、直方和自动对象分割。
通过隔离特定大小的对象或移除小对象来优化阈值分割结果。
通过在排除模式下使用画笔工具快速编辑自动分割结果。
绘画工具包括2D/3D画笔、点击、增长、智能网格和捕捉。
矩形、椭圆形、多边形、手绘区域选择工具。
自动对感兴趣区域进行骨架化,或以图形形式获取ROI的骨架。
布尔运算符和形态运算符。
流域变换*。
计算3D和2D流域以完全分割影像数据。
*仅适用于蜻蜓专业版。
7、量化
无论是分析孔隙、纤维、颗粒、相还是其他任何东西,Dragonfly的量化和分析工具都为您提供了强大的图像特征计数、测量和表征选项。
使用包括形状、方向、强度和其他参数在内的参数自动查找、分类、计数、排序和测量对象。
自动对象拆分和合并*。
体积和二维指标,以及孔隙率*、颗粒和空隙分析。
界面表面计算。
交互式表格和直方图报告。
通过测量进行动态重新着色。
常见的骨形态测量,如Bouxsein等人2010所述,JBMR 25(7):1468-86,来自分段骨区域**。
*仅适用于蜻蜓专业版。
**作为单独许可的功能提供。骨骼分析模块不是标准功能。
8、3D建模
为从图像数据和分割对象或模拟生成的多边形模型、矢量场和空间图形创建有意义且信息丰富的可视化。
从3D图像数据和分割对象生成多边形模型。
生成颜色编码的网格,显示边界点之间局部厚度的参考值。
使用伪彩色和不透明度交互式过滤可视化标量。
从分段相中提取界面网格。
绘制三相边界图,并从选定的感兴趣区域计算喉部厚度。
表面简化方法,可实现大型复杂网格的实时交互式可视化。
通过网格点的细分和平滑来细化表面。
根据分段对象和网格计算凸包。
导出为CSV或标准网格文件以进行3D打印。
迭代最近点配准,用于自动配准带有参考的网格。
根据两组网格的法线生成颜色编码的偏差图。
用于执行各种孔隙网络模拟(孔隙网络建模)的现成框架。
矢量场和流动可视化的高级工具,源自测量或模拟。
从3D图像数据或模拟中重建多孔、树枝状和裂缝网络。
创建空间图,其中节点是分支点和端点,线段是连接节点的线。
使用图形分析工具对所选图形、绘图曲折度分布以及修剪图形进行详细分析。
9、介绍和组织
通过带注释的高分辨率屏幕截图揭示关键见解并分享您的研究,并通过易于制作的动画序列讲述动态故事,这些序列可以导出为高清视频文件、动画GIF或上传到Web。
根据摄像机旋转和用户定义的序列生成动画序列和影片剪辑,并直接在Dragonfly中播放项目。
播放和录制自动滚动2D图像堆栈的动画。
导出屏幕截图并创建高分辨率自定义尺寸的图像以进行打印。
在使用蜻蜓时自动录制全屏,光标突出显示。
通过保存包含所有导入数据和已处理对象的会话与同事协作。
使用蜻蜓直观的管理器*组织、管理和共享数据和分析结果。
*作为单独许可的功能提供。管理器不是标准功能。
10、扩展和自动化
Dragonfly的3D分析工作流程可以使用Python进行自定义,也可以使用自定义附加组件进行扩展,这些附加组件可以实现特定的任务和工作流程,以满足您的研究目标。
访问无限工具箱,从Dragonfly用户社区浏览和下载实现新功能和工作流程的扩展。
录制和播放宏以自动执行重复性任务。
生成和编辑复杂的宏,或组合多个宏以进行批处理。
使用Python生态系统中免费提供的强大图像处理算法构建新功能。
访问Python控制台以编写例程脚本。
广泛的技术文档包、有针对性的开发人员工具和Jupyter Notebook教程,适用于有兴趣为Dragonfly编写插件的开发人员以及希望更好地了解产品约定和结构的用户。
在扫描或显微镜系统捕获图像时应用实时更改*。适用的任务包括分类、切片配准、筛选或保存在宏文件中的操作。
*自动处理是仅适用于蜻蜓专业版的标准功能。
11、Pro 2022.2的新功能、产品增强和其他改进
深度学习进行了改进,可加速训练并提高自动图像分割和增强的性能。
实体网格划分简介,允许您创建3D四面体网格以导出到FEA或CFD软件程序。
非刚性配准工具,用于更好地了解对象在4D变形算例中的变形方式。
通过引入无损数据压缩改进了数据管理,可将文件大小减少多达50%。
改进了用于创建高影响力可视化效果的渲染、新的动画选项以及保存和加载影音制作时间线的机会。

使用说明

蜻蜓用户界面的一个重要部分是工作区的概念。工作区是工具和属性面板的特定布局,在退出时被记住,并在启动时恢复。一旦选择了可用面板的有用布局,蜻蜓将始终看起来相同。您可以通过停靠、取消停靠和移除面板来创建和保存自定义工作区(请参阅自定义工作区)。
“蜻蜓”工作区由以下主要部分组成:
菜单栏。。。菜单栏由用于导入数据、保存会话以及访问图像处理和分析工具的项目组成(请参阅菜单栏)。
左侧边栏...左侧边栏是工具面板的默认位置,这些面板排列在选项卡(如“主”和“段”)上,以便于访问。左侧边栏上的“主要”选项卡提供了用于选择场景布局和视图属性、改进可视化、进行基本测量和其他操作的工具(请参阅“主”选项卡),而“分割”选项卡提供了用于图像分割任务的工具(请参阅ROI工具和ROI Painter)。左侧边栏上还提供了其他选项卡,用于专用工作流,例如孔隙网络建模、高光谱影像分析等。

场景和视图...Dragonfly界面的中间大部分包含场景和视图,可在其中显示图像文件、网格、感兴趣区域和其他对象(请参阅场景和视图)。
场景可以像图像数据的单个视图一样简单,也可以包含其他对象,例如注释、感兴趣区域和网格。场景还可以划分为多个视图或线段,以显示场景中包含的对象的多平面重新格式化或3D视图(请参阅场景和视图)。
中间部分中的底部区域是其他面板的默认位置,例如影音制作(请参阅使用影音制作)、Python控制台(请参阅Python控制台)和操作日志查看器(请参阅操作日志查看器)。
右侧边栏...Dragonfly界面的右侧边栏是“属性”选项卡的默认位置,其中包括“数据属性和设置”面板(为所选对象提供信息和设置)以及“数据集工具”选项卡(提供用于处理对象的其他面板)。右侧边栏还包含测量检查器,可让您在直方图上绘制多ROI、标量网格和图形的统计属性,然后在对象的2D和3D视图中突出显示所选范围。
状态栏...停靠在工作区底部的状态栏指示当前选定的状态,并包括用于创建新会话和打开“首选项”对话框的控件。

状态栏选项
当前状态
指示当前选定的状态。某些状态也由光标样式指示。
新会话
创建新会话(有关保存和加载会话的详细信息,请参阅使用会话)。
偏好
打开“首选项”对话框(有关设置应用程序首选项的信息,请参阅设置首选项)。

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