FSL是一个全面的分析工具库，用于 FMRI、MRI 和弥散脑成像数据。功能性磁共振成像包括功能磁共振成像、旋律核磁共振成像、法伯、罗勒核磁共振成像、马鞭草。结构MRI：BET，FAST，FIRST，FLIRT和FNIRT，FSLVBM，SIENA和SIENAX，MIST，BIANCA，MSM fsl_anat。弥散MRI：FDT，TBSS，XTRACT，涡流，充值，涡流，涡流以及GLM / 统计：方面的功能，如GLM 一般建议， 随机化， PALM， 集群， FDR， 双重回归， 毫米， FLOBS。还提供更多其他工具，包括FSLeyes， Fslutils， Atlases， Atlasquery， SUSAN， FUGUE， MCFLIRT， Miscvis， POSSUM， BayCEST， ICA_PNM， FSL-MRS等来提高生产力，大多数工具既可以从命令行运行，也可以作为GUI（“点击”图形用户界面）运行。
功能特色
1、功能性磁共振成像
FEAT-基于模型的分析，例如，用于任务FMRI
MELODIC-基于ICA的无模型分析，例如，用于静息FMRI
FABBER-双回波（ASL/粗体）灌注FMRI
罗勒-来自灌注的定量静息灌注分析ASL FMRI
2、结构磁共振成像
fsl_anat-通用解剖管线脚本，调用以下大多数工具，提供“一站式”综合结构分析
BET-脑提取
快速-组织类型分割
FIRST-皮层下结构的分割
FLIRT&FNIRT-线性和非线性配准
FSLVBM-多主体灰质密度的体素分析
SIENA&SIENAX-结构变化的纵向和横断面分析
3、弥散磁共振成像
FDT-弥散MRI预处理，张量拟合和牵引术
TBSS-多受试者弥散MRI数据集的体素分析
EDDY-改进了扩散MRI数据集的涡流和头部运动校正
TOPUP-改进了弥散MRI数据集的失真校正
4、灌注磁共振成像
罗勒-使用动脉自旋标记进行灌注定量
5、统计学
随机化-基于排列的推理，包括TFCE
PALM-基于排列的推理，包括多变量和表面数据处理
对偶回归-从组ICA生成特定于主题的地图
6、其他工具
FSLeyes-3D/4D图像、时间序列和表面查看器
网络-与网络/连接分析相关的各种工具
FDR-错误发现率阈值
Mm-混合模型阈值
集群-各种基于集群的分析，包括基于GRF的集群推理
Fslutils-其他命令行程序（包括fslmaths和fslstats）
地图集-FSL中包含的各种地图集
苏珊-非线性图像降噪
赋格-基于场图的EPI失真校正
麦克弗利特-头部运动矫正
FLOBS-灵活的血流动力学基础功能
Miscvis-制作摘要图片的程序
lesion_filling-用于用非病变强度填充病变面罩的工具
负鼠-FMRI/MRI图像模拟器
Atlasquery-用于报告掩码或单个坐标的图集标签的工具
使用帮助
屏幕布局
屏幕布局包含以下部分（从上到下）：
页眉
导航栏，用于快速链接的选项卡集合
动态消息框
操作工具栏
用于页面呈现的画布
操作工具栏，与第4部分相同
页底
前四个部分是最重要的，将在下面介绍。
1、页眉
此部分包含以下元素：
网站徽标（可选）：它也是指向首页（主页）的链接。
用户登录：
未登录：提供登录链接
登录：显示您的用户名（指向主页的链接），提供指向用户首选项（设置）的链接和注销链接。
搜索栏：允许您搜索此站点。默认按钮（您可以通过按<ENTER>获得它）进行标题搜索。如果要进行全文搜索，则需要单击其他按钮。
页面路径：显示页面的路径。单击页面标题链接将显示引用此页面的每个页面。如果是子页面，可以点击父页面向上看。
页面跟踪：列出最近访问的五个页面，因此您可以轻松跳回几个页面。您必须启用显示网页访问历史才能看到它。
2、导航栏
这部分是用于快速链接的选项卡集合。默认情况下，有三个选项卡：
最近更改，指向页面的链接，以显示维基的最新修改
FindPage，指向提供搜索和索引功能的页面的链接
帮助内容，指向主帮助页面的链接
除了默认选项卡外，您还可以通过单击每个页面上的添加链接或在用户首选项中编辑快捷链接列表，将您喜欢的页面添加到此栏中。
3、动态消息框
当有消息时，将显示此框。您可以单击清除此提示信息将其关闭，或者当您移动到另一个页面时，它将自动关闭。
4、操作工具栏
这部分是最常用的功能的链接：
编辑，允许您编辑页面
根据您的用户偏好，可能是编辑（文本方式）和编辑（图形界面）让您选择使用哪个编辑器
如果您无权编辑此页面，则会显示只读网页
注释，切换注释的可见性（仅当当前页面有注释时才显示，请参阅注释上的帮助)
信息，显示有关页面的元信息，尤其是完整版本历史记录
显示“修订历史”，显示页面的修订历史记录
显示“一般信息”，显示页面的一般信息
显示图表“网页点击次数和编辑次数”，显示页面点击次数和编辑次数
订阅/取消订阅，允许订阅或取消订阅当前页面的电子邮件通知
添加链接/删除链接，允许在导航栏添加/删除您喜欢的页面
附件，允许操作页面的附件
更多操作：，包含以下常用函数：
源码，显示当前页面的源代码
打印视图，显示不带页眉或页脚的页面的可打印版本
删除缓存，强制重新编译页面
拼写检查，调用拼写检查器
相似网页，打印标题与此页面相似的页面列表
本站地图，打印从此页面引用的页面列表
改名，允许重命名此页面
删除，允许删除此页面
已安装的任何自定义操作。
(!)为方便起见，此工具栏在页面底部重复。
更新日志
6.0版
次要版本修订历史记录在这里。
此版本对较低级别的图像和矩阵库进行了重大更改，以提高较大数据集的功能和性能。
eddyqc在单个受试者和组水平上执行自动dMRI数据评估
FSLeyes：现在包括Jupyter笔记本集成，最大强度投影和新的插件架构。
FSLpy包括某些FSL命令的包装器。
添加了HCP1065标准空间DTI模板
fsl_ents是一个用于从ICA目录中提取组件时间序列的工具（例如使用FIX的输出）
涡流的版本与5.0.11中的版本相同。新版本的eddy将与FSL 6.0.1一起发布
工具现在支持NIFTI-2，尽管目前应将其视为beta功能。
这还包括自上次主要更新以来引入的最新版本的工具：
MIST：用于多模型皮层下分割的工具。
MSM：用于皮质表面配准的工具。
BIANCA：一种自动（训练）分割白质高信号的工具。
